Na de onderbreking maakte Cristiano Ronaldo zijn opwachting en moest Toni Kroos plaats nemen op de reservebank. Het eerste gevaar in de tweede helft was echter afkomstig van Atlético, dat jammerde om een inzet van Raúl Garcia op het aluminium. Na een klein uur spelen kon hij zich revancheren, maar na het heerlijke voorbereidende werk van Juanfran kwam Raúl Garcia niet verder dan een inzet die langs de kruising van het doel van Casillas scheerde. James Rodriguez kon in de tweede helft niet meer imponeren en werd na ruim een uur spelen naar de kant gehaald, ten faveure van Isco. Atlético bleef de meest gevaarlijke ploeg, maar slaagde er maar niet om het bevrijdende tweede doelpunt te maken. Een hard schot van Koke betekende maar net niet de 2-0 en ook een inzet van Griezmann ging rakelings naast. De thuisploeg was de slotfase van de Champions League in Lissabon niet vergeten, maar slaagde er dit keer wel in om Real Madrid tegen te houden. In de blessuretijd stond de ploeg van Ancelotti met tien man op het veld, na een tweede gele kaart voor Luka Modric.